作为E.coli B宿主菌，主要用来进行蛋白表达，细胞内缺少lon蛋白酶和ompT外膜蛋白酶，能够有效避免目的蛋白的降解。BL21系列宿主菌在蛋白表达过程中被广泛使用，该菌株来源于B834。
DE3是溶源性的 λDE3, 所以带有T7 RNA聚合酶的染色体拷贝。该菌株适用于pET系列载体，及其他T7启动子系列载体。
pLacI基因型表明该菌株含有pACYC184质粒，该质粒含有Lac抑制子基因。
