BLR是 RecA（重组酶A缺陷）型菌株，来源于BL21.该菌株提升了质粒单体的产量，这有助于提升含有重复序列的质粒的稳定性，也能提高能够导致DE3噬菌体丢失的质粒的稳定性。BLR菌株同时是lon和ompt蛋白酶缺陷型菌株。DE3是溶源性的 λDE3, 所以带有T7 RNA聚合酶的染色体拷贝。该菌株适用于pET系列载体，及其他T7启动子系列载体。