XL1-Blue感受态细胞能够利用蓝白斑筛选进行重组质粒的鉴定，是使用质粒或Lambda载体进行常规克隆的优良的克隆菌株。XL1-Blue感受态细胞是核酸内切酶缺陷型（end A）宿主菌，这能够有效提升小提质粒DNA的质量。

XL1-Blue感受态细胞是重组缺陷型宿主菌（rec A），能够有效提升插入片段的稳定性。细胞内的hsdR基因突变，能够阻止克隆的DNA被Eco K核酸内切酶系统的酶切。

XL1-Blue感受态细胞中的F’附加体上面的lacI^qZΔM15基因使得改宿主菌能够应用蓝白斑筛选进行克隆质粒的鉴定。